В Warframe существует четыре ключевых фракции. Их количество может увеличиваться по мере выхода обновлений к игре в перспективе, однако это маловероятно.
Эти фракции - Тэнно, Гринин, Корпус и Зараженные. Причем игрок может выбрать только сторону первых, в то время как остальные три доступны исключительно в виде противников.
Каждая фракция имеет собственные сильные и слабые стороны, а также свою мотивацию участвовать в боевых действиях.