Сюжет Tom Clancy's The Division берет за основу эксперимент, случившийся в 2012-м году, когда группа ученых из Америки при поддержке политиков запустила проект "Темная зима", который должен был помочь проверить, как быстро общество способно реагировать на атаки биотеррористов. Симуляция показала большую уязвимость человечества к этому аспекту, по расчетам все стремительно рушилось, появлялись многочисленные жертвы, а от былого цивилизованного общества не оставалось ни следа.
Эпидемия начинается во время так называемой "Черной пятницы", когда народ массово штурмует магазины в погоне за всевозможными скидками, переносясь из денежных купюр на людей, а также через прочие предметы. Игрокам же во всем этом хаосе отводится роль специально подготовленных агентов, которые сражаются за сохранение общества, борясь против вируса и всеми угрозами, связанными с ним.
