Чтобы использовать мутаген в Ведьмак 3, вам нужно для начала четко определиться с тем, какие именно мутагены использовать. Все дело в том, что действие мутагена сохраняется навсегда и изменить его уже будет нельзя, как и нельзя заменить или удалить.
Именно потому в Ведьмак 3 стоит использовать исключительно мощные мутагены, не распыляясь на слабые. Рекомендуется до мутации прокачать до второго уровня талант "Пропитка", что в ветке "Алхимия".
С технической стороны, чтобы использовать мутаген в Ведьмак 3, вам нужно войти в режим медитации, после в раздел "Персонаж", там выбирайте интересующий вас навыки и нажимайте на пробел для запуска применения мутагена.