Сюжет The Last of Us 2 повествует о событиях, разворачивающихся спустя пять лет после действия оригинала. Элли и Джоэл поселились в небольшом, но благополучном городке Джексон в штате Вайоминг, где также обитает и брат Джоэла - Томми. Далее придется включать спойлеры - не читайте следующий абзац если намерены проходить игру, без них рассказать о сюжете невозможно, так как сама его завязка - это спойлер.
Так вот, однажды в ходе патрулирования окрестностей города Элли узнает, что Джоэл не вернулся с Томми из патруля. Она срочно приступает к его поискам, так как все указывает на то, что у старика большие неприятности. Так и оказалось - он был схвачен некой девушкой очень спортивного телосложения с ее группой, прибывших издалека. Как выяснилось, эту девушку зовут Эбби и она - дочь того самого хирурга, которого убил Джоэл, когда вырывал Элли из рук Цикад после того, как узнал, что она умрет после той операции. Эбби прибыла с четко обозначенной целью - месть за отца и таки отомстила, жестоко прикончив Джоэла, но сохранив жизни Элли и Томми. В дальнейшем Элли всячески стремится отомстить Эбби за столь тяжелую потерю, но когда у нее появляется реальный шанс этого сделать, неожиданно отпускает свою неприятельницу. Это - очень краткий пересказ сюжета The Last of Us 2, по факту он гораздо глубже, но данная рубрика подразумевает краткие ответы на вопросы.