К сожалению, случаи, когда вылетает Subnautica, трудно назвать чем-то редким и уникальным - все же игру разрабатывала в течение долгого срока скромная инди-студия без большого бюджета, без внушительного штата сотрудников и без опыта производства больших игр. Как итог - несмотря на общее качество игры, технически она все же не безупречна и может вылетать. Если это происходит - прежде всего убедитесь, что ваш ПК соответствует хотя бы минимальным системным требованиям проекта.
Если это соответствие в порядке, убедитесь, что выставлены настройки графики не слишком высокие для вашей конфигурации (актуально для слабых ПК). Далее последовательно пробуйте обновить драйвера видеокарты, убедиться, что установлены библиотеки DirectX, проверьте целостность кэша в клиенте Steam. В худшем случае можно попробовать переустановить игру. Кроме того, если пиратская версия - она вполне может вылетать, так как ее работоспособность никем не гарантируется.