Геймплей South Park: The Fractured but Whole довольно оригинален по своей сути, причем несмотря на свою визуальную простоту, игра способна озадачить неподготовленного игрока очень нетривиальными решениями головоломок, где требуется искать особый подход к решениям проблем. Кроме того, эта самая визуальная простота еще и обманчива в том, что технически игровой процесс отнюдь не примитивен, так как это довольно глубоко проработанная ролевая игра с десятью классами героев, и это только в оригинальной игре, в то время как DLC добавляют еще два.
В остальном геймплей South Park: The Fractured but Whole во всем похож на первую часть серии, The Stick of Truth, правда, сиквел отличается предоставлением игроку свободы выбора пола своего героя и даже цвета его кожи, при этом чем темнее эта самая кожа будет, тем сложнее игровой процесс. Это никак не сказывается на боях, но влияет на отношение других персонажей и на выплачиваемые гонорары.
