В Sonic Mania есть два бонусных уровня: "Bonus Stage" и "Special Stage". Для того, чтобы попасть на первый на них, вам потребуется для начала собрать на основном уровне 25 колец, включить контрольный столб и запрыгнуть в образовавшийся выше него круг из звездочек. В целом этот уровень вполне соответствует тому, что уже было в играх Sonic the Hedgehog 3 и Sonic & Knuckles: здесь вас ждет трехмерная графика и выглядит, как замкнутая шарообразная поверхность с синими и красными сферами, собирать нужно синие, не задевая красные. Все приходится делать весьма быстро.
Что касается дополнительного уровня в Sonic Mania "Special Stage", то здесь вас ждет все та же трехмерная графика и замкнутая локация, изобилующая поворотами. Там можно попасть через крупные порталы, чтобы догнать НЛО с Изумрудом хаоса. У вас здесь будет определенное число колец, тратящихся каждую секунду, вам этот запас нужно пополнять, ведь едва они будут исчерпаны, уровень закончится поражением.
