Как и в любой другой игре этого жанра, в R2 online имеются боссы, традиционно являющиеся самыми сильными монстрами в игре. Боссов крайне трудно победить в одиночку, приходится либо собирать группу, либо искать исключительно хорошую экипировку.
Кроме обычных боссов в R2 online есть еще рейдовые боссы (имеющие несколько мест возрождения), а также особые рейдовые боссы (для доступа к ним придется выполнить квест и собрать группу), с которых можно получить уникальный лут, недоступный еще где-либо.
Обычные боссы доступны в Колфорте (Стражи Метеоса, Снежная королева, Урук - хай), в Руинах полнолуния (Танатос, Капитан рыцарей Рарки), а также в Акре (Лорд Акрионцев).
Что касается рейдовых боссов, то в Колфорте это Хватафорс, Черная Виверна, Гвардеец ада, Королева Горишей , а также Король - лич, Бельжевит и Спектр, в то время как в Башне Метеоса - Властитель континента, Хранитель сильного яда, Завоеватель океана и Огненный тиран.
Особые рейдовые боссы в R2 online - это Ифрит, Бафомет.
