Морган в Prey является главным героем в игре, может быть как персонажем мужского пола, так и женского, в зависимости от выбора игрока в самом начале.
Морган занимается тестированием экспериментальных нейромодов, незадолго до событий Prey дело дошло до испытаний нейромода загадочной инопланетной формы жизни - Тифонов. Когда нейромод был удален, Морган лишился памяти.
К моменту начала сюжетной линии протагонист уже несколько недель переживал один и тот же день, не подозревая, что раз за разом исследует нейромоды Тифонов как будто впервые. Но Морган не так прост: он создал резервные ячейки своей же памяти на всякий случай, запрограммировав несколько операторов.
Когда Тифонам удалось вырваться из лаборатории и захватить станцию, оператор "Январь" запустил программу, по которой Морган в Prey должен уничтожить станцию, чтобы предотвратить вторжение врага на Землю. Выполняя поручения "Января", мы в роли Моргана в Prey будем собирать ключи для самоуничтожения станции, попутно узнавая о все, что тут случилось.