Микробы в Oxygen Not Included вполне себе соответствуют своему прототипу из реальной жизни и приносят обычно лишь неприятности: именно они служат разносчиком для различных болезней, вроде пищевого отравления или легочной слизи. Обычно начинают распространяться вокруг объектов, вроде туалета и тому подобных. Помогают им распространяться и сами дубликанты, если на них эти же микробы находятся: такому персонажу достаточно просто прикоснуться к любой поверхности или взять ресурсы, чтобы на последних тут же появились те самые микробы.
Избежать обширного их распространения можно различными способами: эффективнее всего будет использование умывальника, раковины, душа, дезинфектора рук, дезинфектора руды и хлора.
