Вспышка в Outlast 2 появляется редко, но метко: за все время прохождения мы ее видим буквально считанные разы, однако каждый раз эти самые вспышки приводят к очень серьезным последствиям, тяжелые галлюцинации главного героя среди которых - едва ли не самая мелочь. Кажется, он от этих вспышек просто сходит с ума, а природа окружающая страдает не меньше. Да что там природа, не выдерживает даже техника, вы только вспомните, от чего вертолет в самом начале упал.
Так вот, что до источника вспышек, то ответ тут однозначен: это только работа вышек, заметных на некоторых локациях вдали. А из найденных документов при обыске местности можно понять, что вышки и излучение от них - это эксперименты по влиянию СВЧ-волн на психику человека. Отсюда тут и такая вакханалия творится.