В Mortal Kombat XL предусмотрены довольно разные режимы, среди которых основным можно считать, пожалуй, сюжетный: он повествует историю, попутно позволяя игрокам освоиться со здешней игровой механикой, которая также разбавляет традиционные сражения сценами QTE во ходе роликов, однако последние необязательны для выполнения, в случае игнорирования меняются события самого ролика, но только не глобального сюжета.
Кроме того, есть режим Живые башни, доработанные версии Башни Испытаний из прошлой части серии. Таких башен три, в них по-разному меняются испытания: в первой - раз в час, во второй - раз в день, в третьей - раз в неделю. Есть также классические мини-игры Test Your Might и Test Your Luck, режим Kustom Kombat (обычные сражения для игроков друг против друга с заданными модификациями боя, можно играть только в оффлайне). Присутствует также и режим King of the Hill, знакомый уже ценителям по предыдущей игре, как и Крипт.
