В Metro Exodus локации весьма разнообразны на фоне прошлых частей ввиду того, что основное действие перенеслось из тесных подземных тоннелей на поверхность. Кроме того, еще большему контрасту способствуют разные времена года и время суток. Суммарно насчитывается шесть локаций.
Первая - Москва: уровень короткий и линейный, ключевая его суть - сражение за паровоз Аврора, который и позволяет осуществлять путешествие.
Вторая - Волга: это уже полноценная большая локация, находится в 776 километрах от столицы, путь перекрыт местной бандой Огнеборцев, нужно расчистить дорогу.
Третья - Ямантау: еще дальше на восток, от Москвы уже 2 718 километров. На локации имеется бункер, где скрывалось правительство. В целом все линейно и довольно быстро проходится.
Четвертая - Каспий: большая открытая локация, где мы противостоим Барону - местному тоталитарному управленцу, внедрившему рабовладельческий строй. 3 901 километр от Москвы.
Пятая - Тайга: это 6 481 километр от Москвы, последняя открытая и большая локация в игре. На месте противостоят друг другу дети леса и бандиты.
Шестая - Мертвый город. Новосибирск: финальная геймплейная локация в игре, довольно короткая и целиком линейная. 6 988 километров от Москвы, действие разворачивается в местном метро, кишащем новыми видами мутантов.