В Kenshi фракции в целом очень многочисленные и разнообразные, однако среди всех них выделяется три, которые относятся к основным. Разберем их по порядку.
Святая Нация - религиозные фанатики, которые агрессивно настроены по отношению ко всем расам, за исключением человеческим. Однако наибольшую неприязнь испытывают к фракции Ниндзя-отщепенцев. Кроме того, резко негативное отношение у них и к персонажам женского пола. Во главе фракции стоит лорд Феникс, обитающий на локации Бугристый Холм.
Королевство шеков - воинственная фракция, которая состоит из воинов-шеков, однако к моменту событий игры находится в упадке и пытается возродить былую мощь, так как ей пришлось перенести затяжной конфликт со Святой Нацией. Собственно, именно последние являются главными врагами для Королевства шеков, однако также негативное отношение к Изгоям и Союзным городам, однако с теми прямых военных конфликтов нет. Фракцию возглавляет Каменный Голем Эсата, который обитает в Адмаге.
Союзные Города - еще одна из основных фракций в Kenshi, причем самая многочисленная среди всех. Дело в том, что она имеет тесные связи со многочисленными мелкими фракциями, что обеспечивает ей мощную поддержку. В самом государстве же случаются волнения, поднятые бедняками из провинций и прочими мятежниками. Возглавляет Союзные Города Император Тэньгу, который находится в Грузе (Великая пустыня).
