Сюжет Hollow Knight повествует о событиях, которые разворачиваются в вымышленной вселенной в мире насекомых под названием Hallownest. Некогда в этом месте кипела жизнь, все развивалось и процветало, однако к моменту действия игры пришло в серьезный упадок, спровоцированный пришедшей эпидемии чумы. Эта самая эпидемия вытащила из жителей души, оставив части разума - то есть все вроде как и умерли, но все еще живут даже после своей смерти.
Играть в нам предстоит за безымянного одинокого рыцаря, который бродит по руинам огромного города, попутно встречая различных персонажей - как дружественных и нейтральных, так и враждебных. Чтобы лучше понять сюжет Hollow Knight, вам придется внимательно исследовать различные предметы, таблички, слушать других персонажей и так далее - готовую историю вам никто так просто не изложит.