Действие Far Cry 6 происходит в вымышленном разработчиками государстве под названием Яра. Согласно лору игры, географически последняя располагается где-то в бассейне Карибского моря неподалеку от Кубы. По факту же Яра, несмотря на то, что та самая упомянутая уже Куба в игре также формально присутствует (поскольку упоминается), практически во всех аспектах создавалась на основе именно Кубы. На это указывает множество моментов, начиная особенностями архитектуры, природы, ландшафта, флоры и фауны и заканчивая транспортом и оружием.
К моменту событий Far Cry 6 Яра страдает от гнета своего авторитарного правителя Антона Кастильо, устроившего тут настоящую жестокую диктатуру, с чем нам и предстоит попробовать побороться.