Сам Fallout 4 устроен таким образом, что перезаряжать оружие вы можете только в случае наличия патронов или питательных элементов к нему. Чтобы правильно подобрать необходимый боекомплект, посмотрите характеристики оружия в игре. Там четко написано, какие патроны вы можете использовать.
Если же вы не можете перезарядить оружие в Fallout 4, то либо у вас отсутствуют патроны, либо само оружие оказалось сломанным. Так же невозможность перезарядить оружие наступает, если у вас серьезные повреждения организма, связанное с переломами обоих конечностей.