Многие игроки в самом начале не могут определиться, к какой фракции присоединиться. Часто возникает вопрос о том, какие цели преследует в Fallout 4 Институт: хорошие или плохие? Однозначного ответа на этот вопрос нет, потому что любая из четырех представленных в игре фракций стремится навести порядок и возродить жизнь на Земле. Только вот у каждого сообщества разные методы и инструменты для их достижения. Ученые из Института работают над созданием искусственных форм жизни, считая, что все другие организмы, оставшиеся на Земле, неинтересны и бесперспективны для ее развития.
Охраняют Институт синты - роботы, созданные внутри этой организации. Они внешне напоминают людей и обладают высоким интеллектом. Играть за Институт или нет - личное дело каждого. Только стоит учитывать то, что от выбора зависит развитие сюжета и концовка.