В целом в Black Mesa персонажи не особо многочисленны - это обусловлено во многом неразговорчивостью главного героя, потому остальные общаются разве что между собой. Кроме того, их количество обусловлено и тем, что авторы были связаны по рукам оригинальной игрой, где их (персонажей) было ровно столько же.
Выделяя ключевых героев, начать стоит с Гордона Фримена - главного героя, молодого ученого, трудящегося в Черной Мезе.
Его более возрастные коллеги Илай Вэнс и Айзек Кляйнер встречаются лишь на ранней стадии игры и они стоят во главе неудачного эксперимента. Их же можно повстречать и во второй части серии.
Также очень выделяется загадочный G-man, однако про него трудно что-то сказать, так как он загадочен, его возможности выходят далеко за пределы человеческих, не ясна мотивация и цели.
К персонажам условно можно относить и противников, однако они не разговаривают, потому смысла их разбирать детально нет.