Классы в Biomutant представлены пятью разновидностями, каждый из которых очень отличается друг от друга стартовым оружием и пассивными умениями, а вот всевозможные техники и способности варьируются свободно и не имеют привязки к какому-то одному конкретному классу.
- Меткач: самый универсальный класс, имеющий хороший баланс; вооружен изначально двуручный меч, револьвер и ветки техник, связанные с ними;
- Коммандос: класс, специализирующийся на дальнем бою; этому способствует оснащение автоматической винтовкой, но есть также нож, также имеются связанные с ними ветки техник;
- Пси-чистота: здешний аналог мага; имеет на вооружении стихийные перчатки ближнего боя, но имеется также револьвер, способность "Искристый шар", а также ветки техник, связанные с ними;
- Диверсант: класс-разбойник, имеет на старте парное оружие "Сай", револьвер, а также традиционные ветки техник, связанные с ними;
- Страж: последний класс, который по характеристикам напоминает классического танка; имеет тяжелое оружие ближнего боя, а также револьвер и набор техник, связанных с ними.