Улучшать навыки в Assassin's Creed: Unity можно вполне себе стандартным для большинства игр методом: здешняя система развития персонажа предусматривает получение очков навыков, которые нужно распределять удобным для себя образом, тем самым прокачивая своего персонажа.
Очки навыков выдаются по мере прохождения разных заданий, также они выдаются за определенную деятельность. Что именно улучшать - решать вам и только вам, все зависит от выбранного вами стиля игры - кому-то будет удобнее улучшать навык скрытности, кому-то - навигацию, а кому-то - непосредственно сражения, бой.