Сюжет Assassin’s Creed Origins рассказывает о непростой жизни последнего из меджаев - Байека из Сивы, а также о его взаимоотношениях с супругой Айей, вместе с которой им пришлось перенести немало трудностей, в том числе и потерю единственного сына, за которого главный герой и мстит зарождающемуся ордену тамплиеров, выходя на ее лидеров и истребляя по одному, едва удается вычислить нужную личность.
В целом глубина сюжета не особо большая, что для игр этой серии в целом и свойственно. Далее небольшой спойлер, так что если хотите проходить игру - лучше прекратить читать данный абзац. Так вот, вместе с Айей наш герой в противовес вражеской фракции ближе к финалу основал братство "Незримые", которое стало первым этапом становления будущего ордена асассинов.
