Сюжет Armored Core 6: Fires of Rubicon повествует о событиях в отдаленном будущем, где человечество уже активно осваивает далекие миры. В ходе таких исследований люди однажды нашли некое загадочное вещество, прозванное ими "кораллом" - этакий мощный источник энергии, который предсказуемо заинтересовал многих.
В какой-то момент добыча материала привела к большому природному катаклизму и на время все остановилось, но затем человечество вернулось на эту планету, однако на этот раз за ресурс началась нешуточная борьба между различными корпорациями и правительством.
Игрокам отводится роль кибернетического наемника, который без проблем берется за любую работу, предложенную противоборствующими сторонами.
